Microsofts KI für gutes Labor hat Seq2Symm erstellt, ein Open-Supply-KI-Software, mit dem Wissenschaftler die 3D-Formen bestimmter Proteine bestimmen können, einschließlich der in Viren gefundenen.
SEQ2SYMM verwendet AI, um die 3D-Kind und -struktur eines Proteins aus einer eindimensionalen Sequenz vorherzusagen. Das Software könnte Forschern helfen, Krankheiten besser zu verstehen, Medikamente und Impfstoffe zu entwickeln und nachhaltigere Materialien zu schaffen.
Juan Lavista FerresCVP und Chefdatenwissenschaftler und Meghana Kshirsagar, leitender Forschungswissenschaftler und leitender Forscher des Projekts, setzten sich mit Mobihealthnews SEQ2SYMM zu diskutieren und wie sich dies auf die Gesundheitsversorgung und mehr auswirken könnte.
Mobihealthnews: Kannst du mir von SEQ2Symm erzählen?
Juan Lavista Ferres: Im Allgemeinen wissen wir, dass Proteine, insbesondere die Symmetrie von Proteinen, sehr wichtig sind. Proteine sind wichtig, von Bereichen wie der Entdeckung von Arzneimitteln bis zur Energie. Viele der Dinge, die wir als lebendiger Organismus tun, hängen von Proteinen ab. Das Verständnis von Proteinen und das Design dieser Proteine hilft additionally vielen Forschern, und ein grundlegender Aspekt davon ist das Verständnis der Symmetrien.
Bisher gab es bis zu dieser Entdeckung Möglichkeiten, die Symmetrie vorherzusagen, aber es warfare nicht sehr, dass Sie es nicht sehr schnell tun konnten. Die ganze Idee dieser Modelle … der Hauptbeitrag ist die Tatsache, dass wir diesen Aspekt jetzt viel schneller machen können. Wenn wir so viel schneller tun können, werden wir Forschern helfen, ihre Arbeit viel schneller zu erledigen. So können wir die Forschungsentdeckung beschleunigen.
Meghana Kshirsagar: Juan ist insofern Recht, als der Hauptbeitrag dieser Arbeit zum Verständnis von Proteinen einer bestimmten Artwork von Proteinen, die viele wiederholende Einheiten enthalten und diese als Homo-Oltomere enthalten. Diese sind sehr wichtig, weil sie in vielen lebenden Organismen auftreten. So erscheinen sie zum Beispiel in Viren.
Additionally sind diese (sind (Siehe Bild oben), zum Beispiel Viruskapsiden. Sie sind diese kugelförmigen Strukturen, die in quick allen Viren vorhanden sind. Und was die Viren tun, ist, dass sie ihre DNA in diese Kapselstruktur legen, und dies wird dann in unsere Zellen gesteckt, wenn das Virus in unseren Körper kommt. Und dann wird dies auseinander brechen, und dann kommt die Virus -DNA heraus und multipliziert. Dies besteht aus diesen sich wiederholenden Einheiten, und das heißt Homo-Oligomere.
Es gibt additionally 180 Kopien desselben, die diese schöne Kugel wiederholen und bilden, und so dass ein Virus intestine funktioniert, ist dies sehr integral. Dies ist ein sehr wichtiger Teil der Funktionsweise.
Wenn Sie sich eine Pandemie wie Covid ansehen, warfare das erste, was Forscher aus diesem Virus hatten, die Sequenz des Virus, was bedeutet, dass Sie nur eindimensionale Informationen haben. Das heißt additionally, wie: Oh, ich habe nur den Namen eines Menschen, zum Beispiel wie eine Beschreibung einer Particular person, aber Sie haben nicht die 3D -Informationen darüber.
Was unsere Methode tut, ist diese eindimensionale Informationen, die diese 3D-Informationen vorhersagen kann. Es kann sagen, dass es etwas bilden wird, das diese Kind hat, und es enthält diese vielen Kopien.
Und so können Sie sich so viele Situationen vorstellen, in denen Sie diese 3D-Informationen über das Molekül oder das Protein, an dem Sie interessiert sind, nicht haben. Sie kennen diese eindimensionale Informationen nur.
Aber von dem zum 3D zu gehen ist sehr kritisch, und wir sagen hier voraus, wie viele Kopien und wie die Kind aussehen wird. Und dies ist eine konkrete Anwendung, bei der die Methode verwendet werden kann.
Mhn: Es ist additionally ein Vorhersagemodell.
Kshirsagar: Ja, es ist ein Vorhersagemodell.
Ferres: Wir prognostizieren und dies ist ein Beispiel, das Virus ist ein Beispiel. Aber auch dies ist etwas, was für alles, was ein lebender Organismus ist, von Proteinen abhängt. Dies hat additionally Anwendungen, nicht nur für ein Virus, sondern auch für eine Vielzahl von Problemen, vom Verständnis von Alzheimer bis zur Schaffung neuer Medikamente. Die Artwork von Wirkung und Auswirkungen, die dies hat, ist additionally enorm aufgrund der Abhängigkeit, die wir von besserem Verständnis von Proteinen haben.
Mhn: Sehen Sie einen bestimmten Bereich, in dem es am vielversprechendsten ist? Vielleicht Krebs oder Alzheimer, wie Sie erwähnt haben.
Kshirsagar: Es gibt additionally sicherlich Anwendungen in Alzheimer und bei der Untersuchung von Viren. Dies sind die größten Anwendungen aus Sicht der Gesundheit. Und dann gibt es natürlich eine ganze Reihe von Anwendungen in der Nachhaltigkeit und so weiter.
Mhn: Es ist additionally nicht nur im Gesundheitswesen. Dies kann, wie Sie sagten, mit allen lebenden Organismen verwendet werden.
Kshirsagar: Ja.
Ferres: Genau, und dies schließt von Materialien zu … Aus diesem Grund, einer der Gründe, warum wir uns entschlossen haben, in ein besseres Verständnis der Proteinfaltung zu investieren, haben wir in Zusammenarbeit mit dem Baker -Labor und Gregory Bowman und dem Group mindestens drei bis vier Jahre zusammengearbeitet, wenn nicht sogar mehr, und wir haben uns viel Anstrengungen in diesem Bereich engagiert, insbesondere aufgrund dieser schmalen Wirkung, die dies haben kann.
Dies sind sehr harte Probleme, sehr wichtige Probleme und manchmal nicht das einfachste Projekt, das wir erklären müssen.
Viele Menschen verstehen nicht, warum wir uns so sehr um Proteine kümmern. Dies sind eindeutig die grundlegenden Aspekte von Leben und Materialien und berührt im Grunde alles.
Mhn: Und Sie haben es auch zu einem Open-Supply-Modell gemacht.
Ferres: Dies ist offene Forschung und auch völlig Open Supply. Jeder kann es nutzen, um die Forschung weiter zu forschen. Unsere Auswirkungen sind diese Instruments, damit andere Forscher sie nutzen können. Wir erwarten, dass andere Menschen einen Einfluss haben, additionally ermöglichen wir dies Auswirkungen.
Dies wird Auswirkungen auf die Entwicklung von Krankheiten, das Ziel von Medikamenten und die Erleichterung von Impfstoffen oder neuen Behandlungen haben. Es hat additionally einen breiten Einfluss.
Kshirsagar: Genau wie Juan sagte, da Proteine die grundlegenden Bausteine nicht nur des gesamten Lebens auf der Erde, sondern auch vieler Materialien bilden, führt dies zu wirklich breiten und nützlichen Werkzeugen.
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